MARC details
| 000 -CABECERA |
|---|
| campo de control de longitud fija |
04880nam a22003491i 4500 |
| 001 - NÚMERO DE CONTROL |
|---|
| campo de control |
398910 |
| 003 - IDENTIFICADOR DEL NÚMERO DE CONTROL |
|---|
| campo de control |
ES-MaUEC |
| 005 - FECHA Y HORA DE LA ÚLTIMA TRANSACCIÓN |
|---|
| campo de control |
20240315184925.0 |
| 006 - CÓDIGOS DE INFORMACIÓN DE LONGITUD FIJA--CARACTERÍSTICAS DEL MATERIAL ADICIONAL |
|---|
| campo de control de longitud fija |
a|||| o|||| 00| 0 |
| 007 - CAMPO FIJO DE DESCRIPCIÓN FÍSICA--INFORMACIÓN GENERAL |
|---|
| campo de control de longitud fija |
cr nn 008mamaa |
| 008 - DATOS DE LONGITUD FIJA--INFORMACIÓN GENERAL |
|---|
| campo de control de longitud fija |
231016s2023 sz | o |||| 0|eng d |
| 020 ## - NÚMERO INTERNACIONAL ESTÁNDAR DEL LIBRO |
|---|
| Número Internacional Estándar del Libro |
9783031367731 |
| 024 7# - IDENTIFICADOR DE OTROS ESTÁNDARES |
|---|
| Número estándar o código |
10.1007/978-3-031-36773-1 |
| Fuente del número o código |
doi |
| 040 ## - FUENTE DE LA CATALOGACIÓN |
|---|
| Centro catalogador/agencia de origen |
ES-MaUEC |
| Lengua de catalogación |
spa |
| Centro/agencia transcriptor |
ES-MaUEC |
| Centro/agencia modificador |
ES-MaUEC |
| 050 #4 - SIGNATURA TOPOGRÁFICA DE LA BIBLIOTECA DEL CONGRESO |
|---|
| Número de clasificación |
RA644 .C67 |
| Número de documento/Ítem |
2023 EB |
| 100 1# - ENTRADA PRINCIPAL--NOMBRE DE PERSONA |
|---|
| Nombre de persona |
Zhang, Jiapu |
| Término indicativo de función/relación |
autor |
| Código de función/relación |
aut |
| -- |
http://id.loc.gov/vocabulary/relators/aut |
| 9 (RLIN) |
94226 |
| 245 10 - MENCIÓN DE TÍTULO |
|---|
| Título |
Optimization-based Molecular Dynamics Studies of SARS-CoV-2 Molecular Structures : |
| Resto del título |
Research on COVID- 19 |
| Mención de responsabilidad, etc. |
by Jiapu Zhang |
| 250 ## - MENCIÓN DE EDICIÓN |
|---|
| Mención de edición |
1st ed. 2023 |
| 264 #1 - PRODUCCIÓN, PUBLICACIÓN, DISTRIBUCIÓN, FABRICACIÓN Y COPYRIGHT |
|---|
| Producción, publicación, distribución, fabricación y copyright |
Cham |
| Nombre del de productor, editor, distribuidor, fabricante |
Springer Nature Switzerland |
| Fecha de producción, publicación, distribución, fabricación o copyright |
2023 |
| 300 ## - DESCRIPCIÓN FÍSICA |
|---|
| Extensión |
1 recurso en línea |
| 336 ## - TIPO DE CONTENIDO |
|---|
| Término de tipo de contenido |
texto |
| Código de tipo de contenido |
txt |
| Fuente |
rdacontent |
| 337 ## - TIPO DE MEDIO |
|---|
| Nombre/término del tipo de medio |
electrónico |
| Código del tipo de medio |
c |
| Fuente |
rdamedia |
| 338 ## - TIPO DE SOPORTE |
|---|
| Nombre/término del tipo de soporte |
recurso electrónico |
| Código del tipo de soporte |
cr |
| Fuente |
rdacarrier |
| 490 0# - MENCIÓN DE SERIE |
|---|
| Mención de serie |
Springer Series in Biophysics |
| Número Internacional Normalizado para Publicaciones Seriadas |
1868-2561 |
| Designación de volumen o secuencia |
23 |
| 505 0# - NOTA DE CONTENIDO CON FORMATO |
|---|
| Nota de contenido con formato |
1 Papain-Like cysteine protease (PLpro) -- 2 3C-Like protease (3CLpro) -- 3 RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) -- 4 RNA-helicase -- 5 RNA-helicase binding with [RdRp, NSP7, NSP8a, NSP8b, pRNA, tRNA, ADP-Mg2+, ATP-Mg2+] -- 6 RNA-helicase binding with [ADP-Mg2+, ATP-Mg2+, and RNA] -- 7 Spike (S) glycoprotein -- 8 Spike (S) glycoprotein D614G mutant -- 9 Spike (S) glycoprotein N501Y mutant -- 10 Spike (S) glycoprotein N165A-and-N234A mutant -- 11 SARS (SARS-CoV-1) -- 12 MERS-coronavirus (MERS) -- 13 Human-ACE2, human-L6, human-L6R, human-nAChRs -- 14 PLpro binding with 12 compounds -- 15 3CLpro binding with N3/Lopinavir/Ritonavir -- 16 3CLpro dimer binding with 7 HIV-inhibitors and Others -- 17 Spike RBDs binding with 50 drugs -- 18 Human ACE2 ectodomain binding with 78 drugs -- 19 Spike-and-ACE2 binding with 100 drugs -- 20 Envelope protein (E-protein) -- 21 Membrane glycoprotein (M-protein) -- 22 Nucleocapsid phosphoprotein (N-protein) -- 23 SARS-CoV-2 RNA genome -- 24 NSP7, NSP8, NSP9, NSP10, NSP16, NSP14 -- 25 NSP15 -- 26 Other mutants -- 27 Vaccines and Drugs -- 28 Pandemic Mathematical Models, Epidemiology and Virus Origins -- A Mathematical Optimization Algorithms and Free Energy Calculations -- References -- Index. |
| 520 ## - SUMARIO, ETC. |
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| Sumario, etc. |
COVID-19 has brought us extensive research databases in the fields of biophysics, biology, and bioinformatics. To extract valuable structural bioinformatic information of SARS-CoV-2 structural and nonstructural proteins, it is necessary to work with large-scale datasets of molecular dynamics (MD) trajectories that need to be optimized. This monograph serves as a comprehensive guide to optimization-based MD studies of the molecular structures of SARS-CoV-2 proteins and RNA. The book begins by performing local optimization, taking into account the three-body movement and optimizing the noncovalent bonds of each molecular structure. The optimized structures reach a transition state that offers the best stability and lowest energy. The optimization process utilizes a hybrid strategy that combines mathematical optimization with various local search algorithms. This approach significantly reduces data volume while eliminating irrelevant bioinformatics data. To gain a thorough understanding of molecular stability and the mechanism of action, it is essential to consider not only static NMR, X-ray, or cryo-EM structures but also dynamic information obtained through MD or Quantum Mechanics/Molecular Mechanics (QM/MM) simulations. These simulations capture the internal motions and dynamic processes of molecules. Furthermore, for each protein, the structural bioinformatics obtained from the optimized structure is validated by analyzing large-scale MD trajectory databases, which are openly and freely available online. The analysis includes key structural bioinformatics aspects such as salt bridge electrostatic interactions, hydrogen bonds, van der Waals interactions, and hydrophobic interactions specific to each SARS-CoV-2 molecular structure. The book also delves into discussions on drugs, vaccines, and the origins of the virus. Additionally, pandemic mathematical models, including those incorporating time delays, are explored. This book is particularly valuable for professionals working in practical computing roles within computational biochemistry, computational biophysics, optimization and molecular dynamics, structural bioinformatics, biological mathematics, and related fields. It serves as an accessible introduction to these disciplines and is also an excellent teaching resource for students. |
| 988 ## - NOTA LOCAL 598 |
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| Nota local 598 (boletines) |
Springer_BiomedLife_2023 |
| 650 #7 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA |
|---|
| Fuente del encabezamiento o término |
embne |
| 9 (RLIN) |
683668 |
| Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada |
COVID-19 |
| 856 40 - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS |
|---|
| Identificador Uniforme del Recurso |
https://go.openathens.net/redirector/universidadeuropea.es?url=https://doi.org/10.1007/978-3-031-36773-1 |
| Nota pública |
Acceso a este recurso digital (usuarios Universidad Europea de Madrid) |
| 942 ## - ELEMENTOS DE PUNTO DE ACCESO ADICIONAL (KOHA) |
|---|
| Fuente del sistema de clasificación o colocación |
Library of Congress Classification |
| Tipo de ítem Koha |
LIBRO-E NO PRÉSTAMO |
| 998 ## - DATOS ESTADÍSTICOS |
|---|
| Fecha de catalogación |
03/2024 |
| Tipo de materia |
E-book |
| Catalogador |
Isabel Alonso |
| Catalogado |
Sí |